לפני תפקידו הנוכחי, יותם היה מנכ"ל שותף במכון לחינוך דמוקרטי - המקדם תרבות דמוקרטית באמצעות הובלת תהליכי דמוקרטיזציה של מוסדות וארגונים, הכשרת מנהיגות דמוקרטית ובניית רשת השפעה דמוקרטית. במסגרת תפקידו, הוא מנהל כ-120 עובדים שפועלים בכל רחבי הארץ בתוכניות ובפרויקטים שונים של המכון הדמוקרטי. קודם לכן, הוא היה שותף להקמה ולניהול של התוכנית חלוץ חינוכי וניהל את תוכנית הכשרת המורים החממה ליזמות חינוכית חברתית במכללת סמינר הקיבוצים. לפני כניסתו לעולם השינוי החברתי היה יותם טייס בחיל האוויר וניהל פרויקטים באפריקה.