יונתן הוא סמנכ"ל קבוצת קובי בע"מ – עסק משפחתי לייבוא ולשיווק מוצרי חשמל ביתיים. ביחד עם אביו, אחיו וצוות מנהלים נאמנים הוא מנהל את עסקי החברה, כולל רשת חנויות קמעונאית, קבוצת רכישה, אתרי מסחר אלקטרוני וחברות הפצה למותגי חשמל בינלאומיים.