יונית מכהנת כמנהלת חטיבת האיכות והשירותים החברתיים במכון מאירס-ג'וינט-ברוקדייל. קודם לכן שימשה כמנהלת היחידה לתוכניות לאומיות בחברה למתנ"סים - יחידה שכוללת את התוכניות הלאומיות הגדולות של משרד החינוך, כולל היל"ה, קרב, סל תרבות וחוג לכל ילד. לפני כן, מאז שנת 2014, היא הייתה מנכ"לית תוכנית קרב למעורבות בחינוך, שעוסקת בצמצום פערים במערכת החינוך באמצעות הפעלת שיעורי העשרה במסגרת יום הלימודים, ומשתתפים בה 290 אלף תלמידים מכל המגזרים ב-120 רשויות מקומיות. בעבר הקימה יונית בשיתוף הרב ד"ר דני טרופר את תוכנית אפיקים לקידום דתי-ערכי בתיכונים מקיפים דתיים, וניהלה אותה, וגם הקימה וניהלה את בית הספר השש-שנתי פלך ע"ש רות קורמן בקריית עקרון - מוסד פמיניסטי-אינטגרטיבי- אורתודוקסי לבנות.