חיים משמש כמנהל האגף לחינוך ילדים ונוער בסיכון במשרד החינוך. במסגרת תפקידו הוא אחראי על מדיניות המשרד בכל הנוגע לנוער בסיכון, באמצעות שש מחלקות האגף: המחלקה לביקור סדיר - האחראית על כלל הקב"סים במדינה; המחלקה לכיתות ותוכניות שח"ר- האחראית על כיתות מב"ר ואתגר, תל"ם ומל"א; המחלקה לקידום נוער - האחראית על תוכנית היל"ה ועל מרכזי קידום נוער ברחבי הארץ;, המחלקה לרווחה חינוכית, קהילה והורות- האחראית על מרכזי נוער, מועדוניות, תוכניות לגיל הרך ועוד; המחלקה למסגרות מיוחדות - האחראית על המחטי"ם (מרכזי חינוך טכנולוגיים), מפתנים ומוסדות חסות הנוער והכלא; ומחלקת מו"פ - האחראית על כלל ההשתלמויות באגף, מחקרים ושנתון - מניתוק לשילוב. לפני כן שימש חיים כמפקח מסגרות מיוחדות באגף. כיום הוא משמש כמרצה במכללת דוד ילין (בחל"ת) במגמה לחינוך מיוחד ובמגמה לטיפול בעזרת בעלי חיים.